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北宋末开封府尹徐锢之后，建炎四年（1130年）迁居浙江，十三世的高祖父徐经是江阴巨富，“膏腴连延，货泉流溢”，弘治十二年因“会试舞弊案”，与唐寅一起涉案下狱。徐经作《贲感集》以自明，后抑郁死。父亲徐有勉有兄弟6人，母亲王孺人性勤朴，“故好艺植，好纺织”，生子三人，弘祚、弘祖、弘禔（庶子）。至徐霞客时，徐家“田庐不及中人之产”，徐霞客分得家产有200多亩。万历三十五年（1607年）丁未，娶江阴望族许学夷侄女为妻，生子徐屺；后与许学夷畅游惠山，开启旅游之序幕。万历四十五年（1617年）元配许氏病故，隔年续娶罗济之女为妻，生子徐岘。唯罗氏生性凶悍，夫妻感情不睦。霞客却爱上前妻的婢女周氏。罗氏妒恨，乘霞客出远门时，将周氏改嫁李家，“方孕而嫡嫁之”，生子李介立。

徐霞客纵游举国南北，跋涉了许多人烟罕至的荒野地区，往往露宿荒野。足迹遍历今北京、河北、山东、河南、江苏、浙江、福建、山西、江西、湖南、广西、云南、贵州等16省，所到之处，探幽寻秘，并记有游记，记录观察到的各种现象、人文、地理、动植物等状况。

徐霞客尤其对石灰岩地貌进行了深刻的研究和记录，包括溶洞分布，石钟乳、石笋、溶沟、石芽、石梁成因都有详细的考释，是举世第一人。同时对长江源头作了考察，纠正了古代文献对岷山“导江”的错误论断。

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